Pohlavní aparát kocoura tvoří varlata, šourek, penis, předkožka, prostata a bulbouretrální žlázy.
Varlata a šourek
Průměrná velikost varlat kocoura je přibližně 8x4 mm. Jsou uložena v šourku bezprostředně pod análním otvorem. Kůže šourku není volná a je hustě osrstěná.
Penis a předkožka
Penis je uložen v předkožkovém vaku a směřuje dolů a dozadu. Stejně jako u psa probíhá celou délkou penisu kost – os penis. Není vyvinut bulbus penis jako u psa.
Prostata a bulbouretrální žlázy
Prostata na rozdíl od psa neobklopuje celou močovou trubici a u kocoura jsou vyvinuty ještě bulbouretrální žlázy, které jsou uloženy při bázi penisu.
